Der Name Schwabsoien leitet sich von zwei Seen ab, die sich in der Nähe des Ortes befanden. Daher zeigt das Gemeindewappen ein Mühlrad als heraldisches Symbol für Wasser.
Schwabsoien war vermutlich alter Besitz des Hochstifts Augsburg, das bis 1785 die Niedergerichtsbarkeit ausübte. Die für das Wappen gewählten Farben Weiß und Blau weisen darauf hin, dass ab 1785 die unumschränkte Landeshoheit im heutigen Gemeindegebiet bei Kurpfalz Bayern lag
Als Symbol für die geistliche Herrschaft wurde der Bischofsstab in das Wappen aufgenommen und zwar in den Augsburger Farben Rot und Weiß. Der Lilienstab weist auf das Kloster St. Mang in Füssen hin, zu dessen frühesten Besitzungen der Gemeindeteil Sachsenried gehörte.
Der Kiefernzapfen erinnert an den historisch bedeutsamen Sachsenrieder Forst, der wahrscheinlich ein Teil des großen Königsgutes von Kaufbeuren war.
Die Beschreibung des Wappens lautet:
"In Silber eine eingeschweifte blaue Spitze, darin ein silbernes Mühlrad, vorne beseitet von einem roten Bischofsstab, dessen Krümme in einen Kiefernzapfen ausläuft."